MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY060

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016900	TGT	2	6	1060	1065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016900	TGTA	2	8	1089	1096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016900	GAT	2	6	1130	1135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016900	CAT	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016900	CTTCCG	2	12	1160	1171	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016900	AT	3	6	1211	1216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016900	ATT	2	6	1253	1258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016900	CTT	2	6	1269	1274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016900	T	6	6	1652	1657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016900	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016900	GCC	2	6	1996	2001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_016900	GGC	2	6	2100	2105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016900	TCG	2	6	2110	2115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016900	GTT	2	6	2149	2154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016900	GCTC	2	8	2921	2928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016900	AAGA	2	8	3039	3046	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016900	AATCT	2	10	3053	3062	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016900	CT	3	6	3061	3066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016900	TC	3	6	3072	3077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016900	T	6	6	3078	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016900	CGGG	2	8	3125	3132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016900	CGC	2	6	3136	3141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016900	CCAG	2	8	3261	3268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016900	CAG	2	6	3357	3362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016900	CCGG	2	8	3403	3410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016900	GCC	2	6	3430	3435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016900	TCCG	2	8	3459	3466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016900	CGA	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016900	CCA	2	6	3511	3516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016900	CCA	2	6	3521	3526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016900	AGG	2	6	3535	3540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016900	CCT	2	6	3599	3604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016900	CTG	2	6	3663	3668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016900	GATCG	2	10	3683	3692	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016900	GAA	2	6	3701	3706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016900	TCG	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016900	TCC	2	6	4043	4048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016900	TGT	2	6	4072	4077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016900	TTTCCG	2	12	4080	4091	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016900	GTG	2	6	4142	4147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016900	AAC	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016900	TGCG	2	8	4204	4211	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016900	TTCC	2	8	4221	4228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.